Cząsteczka ma prawo wybrać: w jaki sposób diketogenne produkty II klasy MHC wiążą peptydy cd

Powinno to być źródłem znacznej ulgi dla osób, które badają mysz NOD jako model dla ludzkiej cukrzycy typu 1. Istnieją rozbieżności między pulami peptydów zidentyfikowanymi jako zdolne do wiązania się z cząsteczkami MHC klasy II za pomocą metod prezentacji na fagach i bibliotekami peptydowymi oraz tych pobranych jako naturalnie przetworzone fragmenty. W konsekwencji sama architektura kieszeni wiążącej peptyd nie może wyjaśniać niezwykłej zbieżności peptydów związanych przez DQ8 i I-Ag7. Najbardziej uderzającą cechą tej interakcji jest prawie całkowita obecność kwasowej reszty w pozycji 9 (P9) (Figura 1) dla ligandów DQ8 i I-Ag7. Ponadto istnieje coś, co wydaje się być wysoce znaczącym skupiskiem takich kwasowych reszt C-końcowych do P9. Te kwasowe reszty przyczyniają się do interakcji poza właściwym rowkiem wiążącym peptyd. Figura Ligandy peptydowe dla produktów MHC klasy II I-Ag7 (mysz) i HLA-DQ8 (człowiek). Centralny rdzeń ligandu peptydowego oznaczono pogrubioną czcionką; pozostałości kotwicy są oznaczone kolorem ciemnoniebieskim (w P1, P4, P6) i czerwonym (w P9). Reszty aminokwasowe preferowane w kluczowych pozycjach kotwiczących są oznaczone kodem jednoliterowym, przy czym wielkość litery jest proporcjonalna do częstotliwości jej występowania. W P9 ogólnie korzystne są reszty kwasowe (kwas glutaminowy [E] i kwas asparaginowy [D]) i odpowiadają za więcej niż 90% reszt aminokwasowych znalezionych w tej pozycji. Korzystne są również C-końcowe P9, kwasowe reszty (kwas asparaginowy, kwas glutaminowy). Ich częstotliwości są przedstawione jako procent całkowitej liczby analizowanych peptydów, które niosą kwasową resztę we wskazanej pozycji. A, alanina; I, izoleucyna; L, leucyna; Q, glutamina; S, seryna; V, walina. Inne czynniki, które przyczyniają się do generowania kompleksów peptydowych MHC klasy II. Mocna metoda do analizy naturalnie przetworzonych peptydów będzie bardzo przydatna w analizie złożonej odpowiedzi na antygeny trzustkowe. U ludzi, prezentacja epitopów diabetogennych nie jest oczywiście ograniczona do cząsteczki DQ8, o czym świadczy ostatnio zidentyfikowany epitop insuliny A 1A15 ograniczony do DR4 (3). To, czego te podejścia nie mogą wziąć pod uwagę, to krętacki szlak, którym cząsteczki MHC klasy II docierają do miejsca docelowego, gdzie nowo wygenerowane pule peptydów są udostępniane do wiązania się z nimi. Nieobecny w dyskusji jest oczywiste uwzględnienie specyficzności proteazy: gdyby proteazy lizosomalne, które generują ligandy MHC klasy II, miały wykazywać korzystne miejsca cięcia, wówczas pule peptydów udostępnione cząsteczkom klasy II byłyby stronnicze. Jednak nigdy nie było to popularnym poję- ciem ze względu na redundancję proteaz lizosomalnych pod względem specyficzności substratowej. Istnieją jednak przykłady przeciwne: specyficzna dla asparaginy endoproteaza jest rzeczywiście wybiórczo selektywna w wiązaniach peptydowych, które rozszczepia, a enzym jest zaangażowany w wytwarzanie, w wysoce selektywny sposób, epitopów MHC . klasy II (4). . Niemniej jednak istnieje bardzo niewiele przykładów antygenów, dla których szlak przetwarzania został scharakteryzowany kompleksowo pod względem półproduktów i proteaz, które je generują. Może się zdarzyć, że konwergencja wiązania peptydu obserwowana dla DQ8 i I-Ag7, wytwarzana przez identyczne typy komórek prezentujących antygen, zawdzięcza co najmniej składnik tego repertuaru wspólnej maszynie enzymatycznej powyżej. Jako Suri i in. stan (1), poziomy ekspresji źródłowego antygenu i możliwości spotkania z całym aparatem do obróbki i ładowania peptydów z pewnością wpłyną na końcowy wynik, w kategoriach wytwarzanych kompleksów MHC-peptyd. Najlepszą mapą krajobrazu jest sam krajobraz: z tego punktu widzenia kompleksowy zestaw danych przedstawiony przez Suriego i współpracowników pozwoli innym na poruszanie się po obszarze autoimmunizacji z dokładną mapą w ręku. Przypisy Patrz odnośny artykuł od strony 2268. Zastosowano niestandardowe skróty: P9, pozycja 9. Konflikt interesów: Autor zadeklarował brak konfliktu interesów.
[przypisy: olej z konopii indyjskich gdzie kupić, yerba mate przygotowanie, ciasto z owocami przepis ]
[hasła pokrewne: topolowa lublin, padaczka alkoholowa, ortodonta dziecięcy poznań ]